Как применяется совокупность нескольких частей по статье 264?

Мне кажется, что нормы о совокупности здесь не могут применены. Одним деянием причиняется вред одному объекту преступного посягательства - жизни и здороью участников дорожного движения. В соответствии с ч. 2 ст. 17 УК РФ совокупностью преступлений прзнается и одно действие, содержащее признаки преступлений, предусмотренных двумя и более статьями УК РФ. Например, в процессе разбоя потерпевший погиб. Его деяния квалифицируются по п. "з" ч. 2 ст. 105 УК РФ и ст. 162 УК РФ. Эти нормы имеют различные объекты преустпного посягательства - жизнь и здоровье человека по ст. 105 УК РФ и право собственности по ст. 162 УК РФ, что предполагает различное отношение лица к совершаемому деянию. 

В Вашем случае совершено одно деяние, повлекшее различные последствия, совершено  по неосторожности (ст. 26 УК РФ). Деяние будет квалифицироваться  нормой, предусматривающей более тяжкое последствие - ст. 264 ч. 3 УК РФ.

См. ниже

Так ведь назначения наказания по совокупности различаются в зависимости от того, к какой категории относятся совершенные преступления.

Если все преступления, входящие в совокупность, являются только преступлениями небольшой тяжести, то окончательное наказание назначается путем поглощения менее строгого наказания более строгим либо путем частичного или полного сложения наказаний. Выбор принципа назначения наказания по совокупности принадлежит суду.

Для решения вопроса о том, следует ли в каждом конкретном случае применить принцип поглощения или сложения, учитывается характер и степень общественной опасности совершенных преступлений, мотивы и цели каждого из них, форма вины, вид совокупности (идеальная или реальная), обстоятельства, смягчающие и отягчающие наказание, а также данные о личности виновного.

А в данной ситуации ч3 ст 264 относится к преступлению средней тяжести, значит должен применятся принцип полного либо частичного сложения наказаний?

Я считаю, что было совершено одно преступление, а не совокупность: деяние было одно, последствий - два. Форма вины - преступное легкомыслие (ч. 2 ст. 26 УК УФ). Э/то отнощшение лица к совершаемому им преступлению. Преступление будет квалифицироваться по более тяжкой части ст. 264, т.е. по ч. 3. Наказание будет назначено в пределах санкции ч. 3 ст. 264 УК РФ.