Я являюсь Индивидуальным предпринимателем. Могу ли я официально трудоустроиться в ООО?

Здравствуйте!

Законом не запрещено, чтобы ИП где-то еще был трудоустроен работником.

Если будете работать в ООО, заключив трудовой договор, то соответственно это трудовые отношения, регулируемые ТК РФ. И вы будете выступать здесь в роли Работника.

В этом случае, за Работника оплачивает все налоги, страховые взносы Работодатель.

Повторно с этих сумм, т.е. заработной платы, вам уплачивать ничего не надо.

Трудовые отношения правильно оформите:

http://taktaktak.ru/blog/posts/2014/04/ostorozhno-rabotodateli-instruktsiya-p/  Осторожно: работодатели! Инструкция по защите работников