Подан иск на организацию, с которой был заключен договор поставки. Оказалось, что она не является юридическим лицом. Что делать?

Если он не юридическое лицо, значит - физическое (например, ИП - индивидуальный предприниматель) и имеет подсудность в районном суде по гражданскому делу. Других вариантов я не знаю. Не бомж же владеет организацией!

 Здравуствуйте,

для того чтобы понять "кто" перед Вами Вы можете воспользоваться электронными сервисами (если есть хоть какие то реквизиты...какое-то евдь название стояло в документах) - http://egrul.nalog.ru/ или получить платную выписку из егрюл на организацию (модет быть они просто ликвидировались или провели реорганизацию?). 

 Здравтсвуйте !

Как понимать "отзывает наш иск"?

А в реквизитах указанных в договоре были  указаны ИНН и ОГРН?

А какие доводы ответчик проводит по поводу того, что организация не юридиское лицо?

Я так понимаю, что Вы подали иск в Арбитражный суд. Заявите ходатайство об истребовании учредительных документов организации, из которых Вам может стать ясно, кто является надлежащим ответчиком.

Наверняка эта организация является филиалом или иным структурным подразделением головной компании, которая является юридическим лицом и надлежащим ответчиком.