Участник Общества уведомил о своем выходе и обозначил стоимость доли, которую он намерен истребовать с Общества, не совпадающую со стоимостью, определенной внешней оценкой. Как быть?

Здравствуйте, Эльвира, 

поступить следует по закону, которые описывает взаиморасчеты в данной ситуации. От воли сторон они не зависят:

Федеральный закон от 08.02.1998 N 14-ФЗ
(ред. от 29.12.2015)
"Об обществах с ограниченной ответственностью"

Статья 23. Приобретение обществом доли или части доли в уставном капитале общества
6.1. В случае выхода участника общества из общества в соответствии со статьей 26 настоящего Федерального закона его доля переходит к обществу. Общество обязано выплатить участнику общества, подавшему заявление о выходе из общества, действительную стоимость его доли в уставном капитале общества, определяемую на основании данных бухгалтерской отчетности общества за последний отчетный период, предшествующий дню подачи заявления о выходе из общества, или с согласия этого участника общества выдать ему в натуре имущество такой же стоимости либо в случае неполной оплаты им доли в уставном капитале общества действительную стоимость оплаченной части доли......в течение трех месяцев со дня возникновения соответствующей обязанности, если иной срок или порядок выплаты действительной стоимости доли или части доли не предусмотрен уставом общества. 

Таким образом, Вам остется только охнакомиться с полоэжениями устава Вашего ООО, и получить в бухгалтерии расчет действительной стоимости доли.

Действительная стоимость доли участника общества соответствует части стоимости чистых активов общества, пропорциональной размеру его доли (ст.14 указанного закона).
 

Порядок расчета чистых активов бухгалтеру известен, соответствующий документ прилагаю.

Рекомендую выплатить в срок участнику ту сумму, которую Вы определите в результате своих расчетов, так Вы избежите просрочки. В случае его несогласия с ней он сможет обратиться в суд за защитой своих прав.