Начальник не хочет отпускать и плюс ко всему угрожает штрафом неизвестной суммы.

Здравствуйте!

Самовольный уход в оплачиваемый отпуск считается прогулом, с вытекающими последствиями (Постановление Пленума ВС РФ №2 от 17.03.2004).

Отпуск по закону предоставляется в соответствии с графиком отпусков ст.123 ТК РФ.

Случаи, кому отпуск предоставляется  в удобное для них время, указаны вот в этом Алгоритме. Только  в одних случаях, это означает, что в график отпусков должны запланировать в удобное для вас время, а в каких-то случаях, например, как отпуск перед отпуском по БиР не зависит от графика отпусков, т.к. запланировать это невозможно:

http://taktaktak.org/blog/posts/2014/05/11462/ Отпуск в удобное для работника время,— кому он положен?

Вариант есть - оформить отпуск без сохранения зп, но этот отпуск при наличии уважительных причин, которые нужно подтвердить документально, и на усмотрение работодателя ст.128 ТК РФ. Есть случаи, когда отпуск без сохранения зп работодатель обязан оформить:

http://taktaktak.org/blog/posts/2014/06/11927/ - Отпуск без сохранения заработной платы, который работодатель обязан предоставить

Штрафы законом не разрешены, но, если у вас зп "серая", т.е. есть "черная" часть, то работодатель может делать с этой частью, что ему захочется.

А за наличие "черной" части ответственность вплоть до уголовной и у работодателя, и у работника. Так, что еще стоит подумать, нужно ли куда-то жаловаться, о том, что у вас с "черной" части какой-то штраф удержали. Тем более, что вы еще будете обязаны доказать реальный размер зп.