Работодатель потерял заявление на увольнение по собственному желанию и ставит сотруднику прогулы

Я работал в районной больнице врачом до 16.01.2017г, написал заявление об увольнении по собственному желанию 11.01.2017г, отработал до 16.01.2017г, а дальше уехал на учёбу в другой район, о чем был предупрежден работодатель, в самом заявлении об увольнении по собственному желанию. Но до сих пор не получил окончательный расчёт, ещё как вчера узнал: приказа о моем увольнении до сих пор нет, работодатель до сих пор вносит меня в табель как нн, а также каждый день оформляют акт о моём отсутствии на работе. Позвонил главному врачу, он сказал, что они потеряли моё заявление, поэтому мне надо написать заявление заново и только после этого мне дадут увольнение. Что мне делать? В течение 6 месяцев, я оказывается прогуливаясь работу, не зная об этом.